První zmínka o škole v Čejkovicích pochází z roku 1642. Původní budova stála u fary, ale byla zničena při vpádu kuruců v roce 1705. Později byla škola přestěhována do bývalé palírny, která byla postupně upravována a rozšiřována. Výuka probíhala v jedné velké učírně a součástí školy byl i byt učitele. Postupně se škola rozrůstala, od roku 1871 měla tři třídy a na počátku 20. století ji navštěvovalo přes 350 žáků. Podmínky však byly nevyhovující – chyběla voda, elektřina i hygienické zázemí a vyučování probíhalo dopoledne i odpoledne.

Výstavba nové školní budovy začala v roce 1969 a dokončena byla v roce 1975, kdy byla škola slavnostně otevřena. Od roku 1990 nese jméno T. G. Masaryka. V roce 2009 prošla rozsáhlou rekonstrukcí zaměřenou na úspory energií, zahrnující zateplení, novou fasádu, výměnu oken a modernizaci vytápění. Projekt byl financován obcí Čejkovice za podpory Evropské unie a Státního fondu životního prostředí, přičemž celkové náklady dosáhly téměř 18 milionů Kč.

Základní škola T. G. Masaryka v Čejkovicích byla otevřena v roce 1975 a od roku 2001 funguje jako samostatná právnická osoba. Navštěvují ji nejen děti z Čejkovic, ale i ze Starého a Nového Poddvorova a okolí.

Škola sídlí v pavilonové budově v klidné části obce poblíž mateřské školy a zdravotního střediska. Vzdělávání probíhá ve 14 třídách (7 na prvním a 7 na druhém stupni) a doplňují je dvě přípravné třídy. K dispozici jsou odborné učebny, moderní technika včetně notebooků a tabletů i nově vybudované učebny informatiky, jazyková laboratoř a cvičná kuchyně. Ve škole pracuje 24 učitelů, asistenti pedagoga i vychovatelky školní družiny.

Škola klade důraz na otevřenou komunikaci s rodiči, příznivé klima a spolupráci, přičemž usiluje o rozvoj vzdělaných a sebevědomých žáků připravených na další život. Rodiče jsou pravidelně informováni prostřednictvím schůzek, konzultací i školních médií. Součástí školy je družina, rozsáhlý školní pozemek s venkovní učebnou a zázemí pro sport včetně tělocvičen, bazénu a hřišť. Škola má také vlastní jídelnu, která kromě stravování nabízí i další služby pro veřejnost.